Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SRSF4Q08170 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms