Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FMODQ06828 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FMODQ06828 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FMODQ06828 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FMODQ06828 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FMODQ06828 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FMODQ06828 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FMODQ06828 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FMODQ06828 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FMODQ06828 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FMODQ06828 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FMODQ06828 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms