Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC6Q03468 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC6Q03468 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms