Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CAV1Q03135 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms