Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC2Q02487 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms