Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDK3Q00526 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms