Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB15P59190 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB15P59190 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB15P59190 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB15P59190 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB15P59190 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB15P59190 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB15P59190 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms