Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AQP4P55087 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AQP4P55087 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AQP4P55087 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AQP4P55087 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms