Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMSP52788 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMSP52788 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMSP52788 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMSP52788 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMSP52788 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMSP52788 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMSP52788 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMSP52788 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMSP52788 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMSP52788 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMSP52788 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMSP52788 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms