Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCT3P49368 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCT3P49368 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCT3P49368 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms