Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RANGAP1P46060 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RANGAP1P46060 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms