Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CHRNA7P36544 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms