Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJC1P36383 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJC1P36383 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJC1P36383 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJC1P36383 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJC1P36383 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJC1P36383 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJC1P36383 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms