Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTN2P35609 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms