Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC8A1P32418 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms