Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASQ1P31415 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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