Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms