Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GTF2E1P29083 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2E1P29083 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms