Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms