Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PEX2P28328 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX2P28328 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms