Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5F1P24539 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5F1P24539 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms