Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF3P18847 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATF3P18847 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATF3P18847 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATF3P18847 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms