Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms