Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms