Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOP08100 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOP08100 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOP08100 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOP08100 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOP08100 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOP08100 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOP08100 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOP08100 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RHOP08100 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RHOP08100 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RHOP08100 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RHOP08100 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms