Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSLP07711 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSLP07711 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSLP07711 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSLP07711 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSLP07711 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTSLP07711 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSLP07711 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSLP07711 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSLP07711 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSLP07711 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSLP07711 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSLP07711 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSLP07711 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSLP07711 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTSLP07711 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSLP07711 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSLP07711 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSLP07711 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSLP07711 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSLP07711 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSLP07711 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSLP07711 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSLP07711 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSLP07711 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSLP07711 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSLP07711 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSLP07711 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSLP07711 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSLP07711 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSLP07711 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSLP07711 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms