Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOA4P06727 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms