Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms