Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX4O95219 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX4O95219 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms