Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F6O75461 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F6O75461 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms