Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms