Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GABRPO00591 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GABRPO00591 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GABRPO00591 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRPO00591 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRPO00591 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRPO00591 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRPO00591 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRPO00591 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRPO00591 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRPO00591 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRPO00591 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GABRPO00591 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms