Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ERVH48-1M5A8F1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVH48-1M5A8F1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms