Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L12C9JPN9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms