Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms