Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP4S1Q9Y587 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms