Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M1Q9Y2T2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms