Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRPC4Q9UBN4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms