Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARHGAP28Q9P2N2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms