Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC88CQ9P219 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms