Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms