Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms