Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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