Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms