Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms