Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RSG1Q9BU20 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms