Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MCMBPQ9BTE3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms