Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms