Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOL4Q9BPW4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms