Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ELP4Q96EB1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms